Физико-химические свойства белков и методы их определения

 
       Введение

       Белки -  высокомолекулярные азотистые органические вещества, построенные из аминокислот и играющие фундаментальную роль в структуре и жизнедеятельности организмов. Белки - основная и необходимая составная часть всех организмов. Именно Белки осуществляют обмен веществ и энергетические превращения, неразрывно связанные с активными биологическими функциями. Сухое вещество большинства органов и тканей человека и животных, а также большая часть микроорганизмов состоят главным образом из белков (40-50%), причем растительному миру свойственно отклонение от этой средней величины в сторону понижения, а животному - повышения. Микроорганизмы обычно богаче белком (некоторые же вирусы являются почти чистыми белками). Таким образом, в среднем можно принять, что 10% биомассы на Земле представлено белком, то есть его количество измеряется величиной порядка 10¹² - 10¹³ тонн. Белковые вещества лежат в основе важнейших процессов жизнедеятельности. Так, например, процессы обмена веществ ( пищеварение, дыхание, выделение, и другие) обеспечиваются деятельностью ферментов , являющихся по своей природе белками. К белкам относятся и сократительные структуры, лежащие в основе движения, например сократительный белок мышц ( актомиозин), опорные ткани организма (коллаген костей, хрящей, сухожилий), покровы организма ( кожа, волосы, ногти и т.п.) , состоящие главным образом из коллагенов, эластинов, кератинов, а также токсины, антигены и антитела, многие гормоны и другие биологически важные вещества.

       Роль  белков в живом организме подчеркивается уже самим их названием «протеины» (в переводе с греческого protos - первый, первичный), предложенным в 1840 г. голландским химиком Г. Мульдером, который обнаружил, что в тканях животных и растений содержатся вещества, напоминающие по своим свойствам яичный белок. Постепенно было установлено, что белки представляют собой обширный класс разнообразных веществ, построенных по одинаковому плану. Отмечая первостепенное значение белков для процессов жизнедеятельности, Энгельс определил, что жизнь есть способ существования белковых тел, заключающийся в постоянном самообновлении химических составных частей этих тел.

       В природе существует примерно 10¹⁰-10¹² различных белков, обеспечивающих жизнедеятельность организмов всех степеней сложности от вирусов до человека, они обеспечивают жизнь более 2 млн. видам организмов. Белками являются ферменты, антитела, многие гормоны и другие биологические активные вещества. Необходимость постоянного обновления белков лежит в основе обмена веществ. Именно поэтому белки и явились тем исключительным материалом, который послужил основой возникновения жизни на Земле. Ни одно вещество из всех веществ биологического происхождения не имеет столь большого значения и не обладает столь многогранными функциями в жизни организма как белки.

       Ф. Энгельс писал: «Повсюду, где мы встречаем жизнь, мы находим, что она связана с каким-либо белковым телом и повсюду, где мы встречаем какое-либо белковое тело, которое не находится в процессе разложения, мы без исключения встречаем и явления жизни».

       1 Роль индивидуальных  белков в биохимических  исследованиях

       Важное  место в биохимических исследованиях  занимает выделение индивидуальных белков из органов и тканей. Очищенные  индивидуальные белки нужны для  изучения их первичной структуры, получения  кристаллов белков с целью исследования их пространственной структуры методом  рентгеноструктурного анализа, установления взаимосвязи между первичной, пространственной структурой белка и его функцией.

       Некоторые очищенные индивидуальные белки  используют в медицине как лекарственные  препараты, например гормон инсулин  применяют для лечения сахарного  диабета, а пищеварительные ферменты поджелудочной железы назначают  при нарушении её функций в  качестве заместительной терапии. Кроме  того, очищенные ферменты часто используют в биохимических исследованиях  в качестве химических реактивов  для определения веществ в  биологических жидкостях.

       Большинство методов, используемых для очистки  индивидуальных белков, основано на различиях  их физико-химических свойств, а также  возможности специфично связываться  с лигандом.

       2 Физико-химические свойства белков

       Индивидуальные  белки различаются по своим физико-химическим свойствам: форме молекул, молекулярной массе, суммарному заряду молекулы, соотношению полярных и неполярных групп на поверхности нативной молекулы белка, растворимости белков, а также степени устойчивости к воздействию денатурирующих агентов.

1. Различия белков по форме молекул

       Как уже говорилось выше, по форме молекул  белки делят на глобулярные и фибриллярные. Глобулярные белки имеют более компактную структуру, их гидрофобные радикалы в большинстве своём спрятаны в гидрофобное ядро, и они значительно лучше растворимы в жидкостях организма, чем фибриллярные белки (исключение составляют мембранные белки).

2. Различия белков по молекулярной массе

       Белки - высокомолекулярные соединения, но могут  сильно отличаться по молекулярной массе, которая колеблется от 6000 до 1 000 000 Д и выше. Молекулярная масса белка зависит от количества аминокислотных остатков в полипептидной цепи, а для олигомерных белков - и от количества входящих в него протомеров (или субъединиц).

3. Суммарный заряд белков

       Белки имеют в своём составе радикалы лизина, аргинина, гистидина, глутаминовой и аспарагиновой кислот, содержащие функциональные группы, способные к ионизации (ионогенные группы). Кроме того, на N- и С-концах полипептидных цепей имеются α-амино- и α-карбоксильная группы, также способные к ионизации. Суммарный заряд белковой молекулы зависит от соотношения ионизированных анионных радикалов Глу и Асп и катионных радикалов Лиз, Apr и Гис.

       Степень ионизации функциональных групп  этих радикалов зависит от рН среды. При рН раствора около 7 все ионогенные группы белка находятся в ионизированном состоянии. В кислой среде увеличение концентрации протонов (Н+) приводит к подавлению диссоциации карбоксильных групп и уменьшению отрицательного заряда белков: -СОО^- + Н⁺ → -СООН. В щелочной среде связывание избытка ОН^- с протонами, образующимися при диссоциации NH₃⁺ с образованием воды, приводит к уменьшению положительного заряда белков:

-NH₃⁺ +ОН^- → -NH₂ + H₂O.

       Значение  рН при котором белок приобретает суммарный нулевой заряд, называют «изоэлектрическая точка» и обозначают как pI. В изоэлектрической точке количество положительно и отрицательно заряженных групп белка одинаково, т.е. белок находится в изоэлектрическом состоянии.

       Так как большинство белков в клетке имеет в своём составе больше анионогенных групп (-СОО^-), то изоэлектрическая точка этих белков лежит в слабокислой среде. Изоэлектрическая точка белков, в составе которых преобладают катионогенные группы, находится в щелочной среде. Наиболее яркий пример таких внутриклеточных белков, содержащих много аргинина и лизина, - гистоны, входящие в состав хроматина.

       Белки, имеющие суммарный положительный  или отрицательный заряд, лучше  растворимы, чем белки, находящиеся  в изоэлектрической точке. Суммарный заряд увеличивает количество диполей воды, способных связываться с белковой молекулой, и препятствует контакту одноимённо заряженных молекул, в результате растворимость белков увеличивается. Заряженные белки могут двигаться в электрическом поле: анионные белки, имеющие отрицательный заряд, будут двигаться к положительно заряженному аноду (+), а катионные белки - к отрицательно заряженному катоду (-). Белки, находящиеся в изоэлектрическом состоянии, не перемещаются в электрическом поле.

4. Соотношение полярных и неполярных групп на поверхности нативных молекул белков

       На  поверхности большинства внутриклеточных  белков преобладают полярные радикалы, однако соотношение полярных и неполярных групп отлично для разных индивидуальных белков. Так, протомеры олигомерных белков в области контактов друг с другом часто содержат гидрофобные радикалы. Поверхности белков, функционирующих в составе мембран или прикрепляющиеся к ним в процессе функционирования, также обогащены гидрофобными радикалами. Такие белки лучше растворимы в липидах, чем в воде.

5. Растворимость белков

       Растворимость белков в воде зависит от всех перечисленных  выше свойств белков: формы, молекулярной массы, величины заряда, соотношения  полярных и неполярных функциональных групп на поверхности белка. Кроме  этого, растворимость белка определяется составом растворителя, т.е. наличием в  растворе других растворённых веществ. Например, некоторые белки легче  растворяются в слабом солевом растворе, чем в дистиллированной воде. С  другой стороны, увеличение концентрации нейтральных солей может способствовать вьшадению определённых белков в осадок. Денатурирующие агенты, присутствующие в растворе, также снижают растворимость белков.

       3 Методы выделения и очистки белков

       Получение индивидуальных белков из биологического материала (тканей, органов, клеточных  культур) требует проведения последовательных операций, включающих:

•       дробление биологического материала и разрушение клеточных мембран;
•       фракционирование органелл, содержащих те или иные белки;
•       экстракцию белков (перевод их в растворённое состояние);
•       разделение смеси белков на индивидуальные белки.

3.1 Методы разрушения тканей и экстракции белков

       Для разрушения биологического материала  используют методы: гомогенизации ткани, метод попеременного замораживания  и оттаивания, а также обработку  клеток ультразвуком.

       Гомогенизация биологического материала

       Ткань, находящуюся в буферном растворе с определённым значением рН и концентрацией солей, помещают в стеклянный сосуд (гомогенизатор) с пестиком. Вращающийся пестик измельчает и растирает ткань о притёртые стенки сосуда.

         Метод замораживания и оттаивания ткани

       В результате попеременного замораживания  и оттаивания образующиеся кристаллы льда разрушают оболочки клеток.

       После разрушения ткани нерастворимые  части осаждают центрифугированием. Последующее центрифугирование  гомогената с разной скоростью позволяет получить отдельные фракции, содержащие клеточные ядра, митохондрии и другие органеллы, а также надосадочную жидкость, в которой находятся растворимые белки цитозоля клетки. Искомый белок будет содержаться в одной из этих фракций.

       Экстракция  белков, связанных с мембранами, и разрушение олигомерных белков на протомеры

       Если  искомый белок прочно связан с  какими-либо структурами клетки, его  необходимо перевести в раствор. Так, для разрушения гидрофобных  взаимодействий между белками и  липидами мембран в раствор добавляют  детергенты; чаще всего используют тритон Х-100 или додецилсульфат натрия.

       При действии детергентов обычно разрушаются  и гидрофобные взаимодействия между  протомерами в олигомерных белках.

       Удаление  из раствора небелковых веществ

       Нуклеиновые кислоты, липиды и другие небелковые вещества можно удалить из раствора, используя их Особенные физико-химические свойства. Так, липиды легко удаляются  из раствора добавлением органических растворителей, например ацетона. Однако воздействие должно быть кратковременным, так как ацетон вызывает денатурацию  некоторых белков. Нуклеиновые кислоты  осаждают добавлением в раствор  стрептомицина.

       3.2 Методы очистки белков

       Наиболее  трудоёмкий этап получения индивидуальных белков - их очистка от других белков, находящихся в растворе, полученном из данной ткани. Часто изучаемый  белок присутствует в небольших  количествах, составляющих доли процента от всех белков раствора.

       Так как белки обладают конформационной лабильностью, при работе с белками следует избегать денатурирующих воздействий, поэтому выделение и очистка белков происходят при низких температурах.

       На первых стадиях  очистки белков целесообразно использовать методы, учитывающие какую-либо характерную  особенность данного белка, например термостабильность или устойчивость в кислых растворах. Первыми методами очистки необходимо удалить из раствора основную массу балластных белков, которые значительно отличаются от выделяемого белка физико-химическими свойствами. Впоследствии применяют всё более тонкие методы очистки белка.

       Очистка белков избирательной денатурацией

       Большинство белков денатурирует и выпадает в  осадок уже при кратковременном  нагревании раствора до 50-70°С или подкислении раствора до рН = 5. Если выделяемый белок выдерживает эти условия, то с помощью избирательной денатурации можно удалить большую часть посторонних белков, отфильтровав выпавшие в осадок-белки, или осадить их центрифугированием.

       Высаливание

       Метод очистки белков, основанный на различиях  в их растворимости при разной концентрации соли в растворе. Соли щелочных и щёлочно-земельных металлов вызывают обратимое осаждение белков, т.е. после их удаления белки вновь приобретают способность растворяться, сохраняя при этом свои нативные свойства.

       Чаще  всего для разделения белков методом  высаливания используют разные концентрации солей сульфата аммония - (NH₄)₂SO₄. Чем выше растворимость белка, тем большая концентрация соли необходима для его высаливания.

       Гель-фильтрация, или метод молекулярных сит

       Для разделения белков часто используют хроматографические методы, основанные на распределении веществ между двумя фазами, одна из которых подвижная, а другая неподвижная. В основу хроматографических методов положены разные принципы: гель-фильтрации, ионного обмена, адсорбции, биологического сродства.

       Метод разделения белков с помощью гель-фильтрационной хроматографии основан на том, что вещества, отличающиеся молекулярной массой, по-разному распределяются между неподвижной и подвижной фазами. Хроматографическая колонка заполняется гранулами пористого вещества (сефадекс, агароза и др.). В структуре полисахарида образуются поперечные связи и формируются гранулы с "порами", через которые легко проходят вода и низкомолекулярные вещества. В зависимости от условий можно формировать гранулы с разной величиной "пор".

       Неподвижная фаза - жидкость внутри гранул, в которую  способны проникать низкомолекулярные  вещества и белки с небольшой  молекулярной массой. Смесь белков, нанесённую на хроматографическую колонку, вымывают (элюируют), пропуская через колонку растворитель. Вместе с фронтом растворителя движутся и самые крупные молекулы.

       Более мелкие молекулы диффундируют внутрь гранул сефадекса и на некоторое время попадают в неподвижную фазу, в результате чего их движение задерживается. Величина пор определяет размер молекул, способных проникать внутрь гранул (рисунок 1).

Рисунок 1 - Разделение смеси белков методом гель-фильтрации

       Так как гелевая структура сефадекса легко деформируется под давлением, гели стали заменять более жёсткими матрицами (сефактил, той-оперл), представляющими сферические гранулы с разными размерами пор. Выбор размеров пор в гранулах зависит от целей хроматографии.

       Ультрацентрифугирование

       Метод разделения также основан на различии в молекулярных массах белков. Скорость седиментации веществ в процессе вращения в ультрацентрифуге, где центробежное ускорение достигает 100 000-500 000 g, пропорционально их молекулярной массе. На поверхность буферного раствора, помещённого в кювету, наносят тонкий слой смеси белков. Кювету помещают в ротор ультрацентрифуги. При вращении ротора в течение 10-12 ч более крупные молекулы (с большей молекулярной массой) оседают в буферном растворе с большей скоростью. В результате в кювете происходит расслоение смеси белков на отдельные фракции с разной молекулярной массой (рисунок 2). После расслоения белковых фракций дно кюветы прокаливают иглой и по каплям собирают содержимое небольшими порциями в пробирки.

Рисунок 2 - Кювета, заполненная буферным раствором с разделёнными белковыми фракциями

       Электрофорез  белков

       Метод основан на том, что при определённом значении рН и ионной силы раствора белки двигаются в электрическом поле со скоростью, пропорциональной их суммарному заряду. Белки, имеющие суммарный отрицательный заряд, двигаются к аноду (+), а положительно заряженные белки - к катоду (-).

       Электрофорез  проводят на различных носителях: бумаге, крахмальном геле, полиакриламидном геле и др. В отличие от электрофореза  на бумаге, где скорость движения белков пропорциональна только их суммарному заряду, в полиакриламидном геле скорость движения белков пропорциональна их молекулярным массам.

       Разрешающая способность электрофореза в  полиакриламидном геле выше, чем на бумаге. Так, при электрофорезе белков сыворотки крови человека на бумаге обнаруживают только 5 главных фракций: альбумины, α₁ глобулины, α₂-глобулины, β-глобулины и γ-глобулины (рисунок 3). Электрофорез тех же белков в полиакриламидном геле позволяет получить до 18 различных фракций. Для обнаружения белковых фракций полоски бумаги или столбики геля обрабатывают красителем (чаще всего бромфеноловым синим или амидовым чёрным). Окрашенный комплекс белков с красителем выявляет расположение различных фракций на носителе.

Рисунок 3 - Электрофорез белков сыворотки крови  здорового человека на бумаге.

       Ионообменная  хроматография

       Так же как и электрофорез, метод основан  на разделении белков, различающихся  суммарным зарядом при определённых значениях рН и ионной силы раствора. При пропускании раствора белков через хроматографическую колонку, заполненную твёрдым пористым заряженным материалом, часть белков задерживается на нём в результате электростатических взаимодействий.

       В качестве неподвижной фазы используют ионообменники - полимерные органические вещества, содержащие заряженные функциональные группы.

       Различают положительно заряженные анионообменники, среди которых наиболее часто используют диэтиламиноэтилцеллюлозу (ДЭАЭ-целлюлозу), содержащую катионные группы, и отрицательно заряженные катионообменники, например карбоксиметилцеллюлозу (КМ-цел-люлозу), содержащую анионные группы.

       Выбор ионообменника определяется зарядом  выделяемого белка. Так, для выделения  отрицательно заряженного белка используют анионообменник. При пропускании раствора белка через колонку прочность связывания белка с анионообменником зависит от количества отрицательно заряженных карбоксильных групп в молекуле. Белки, адсорбированные на анионообменнике, можно смыть (элюировать) буферными растворами с различной концентрацией соли, чаще всего NaCI, и разными значениями рН. Ионы хлора связываются с положительно заряженными функциональными группами анионообменника и вытесняют карбоксильные группы белков. При низких концентрациях соли элюируются белки, слабо связанные с анионообменником. Постепенное увеличение концентрации соли или изменение рН, что меняет заряд белковой молекулы, приводит к выделению белковых фракций, в одной из которых находится искомый белок.

       Аффинная  хроматография, или хроматография  по сродству

       Это наиболее специфичный метод выделения  индивидуальных белков, основанный на избирательном взаимодействии белков с лигандами, прикреплёнными (иммобилизированными) к твёрдому носителю. В качестве лиганда может быть использован субстрат или кофермент, если выделяют какой-либо фермент, антигены для выделения антител и т.д. Через колонку, заполненную иммобилизованным лигандом, пропускают раствор, содержащий смесь белков. К ли-ганду присоединяется только белок, специфично взаимодействующий с ним; все остальные белки выходят с элюатом (рисунок 4). Белок, адсорбированный на колонке, можно снять, промыв её раствором с изменённым значением рН или изменённой ионной силой. В некоторых случаях используют раствор детергента, разрывающий гидрофобные связи между белком и лигандом.

Рисунок 4 - Аффинная хроматография

       Аффинная  хроматография отличается высокой  избирательностью и помогает очистить выделяемый белок в тысячи раз.

3. Очистка белков от низкомолекулярных примесей

       Для удаления низкомолекулярных соединений, в частности сульфата аммония  после высаливания, применяют диализ. Метод основан на том, что через полупроницаемую мембрану, пропускающую низкомолекулярные вещества, не проходят белки, имеющие более высокую молекулярную массу. В стакан большой ёмкости (около 1 л) с буферным раствором помещают полупроницаемый мешочек, заполненный раствором белка с солью.

       Скорость  выхода соли из мешочка в буферный раствор пропорциональна градиенту  его концентраций по обе стороны  от мембраны. По мере выхода соли из мешочка  буферный раствор в стакане меняют.

       Для очистки белков от низкомолекулярных  примесей используют также метод гель-фильтрации.

       Для определения частоты (гомогенности) выделенного белка применяют методы с высокой разрешающей способностью, например электрофорез в полиакриламидном геле, высокоэффективная хроматография высокого давления. От чистоты лекарственного белкового препарата зависят его биологическая эффективность и аллергенность (т.е. способность вызывать аллергические реакции). Чем качественнее очищен препарат, тем меньше вероятность осложнений при его применении.

       Заключение

       В данной работе при помощи различных схем и рисунков были рассмотрены физико-химические свойства белков (молекулярная масса, форма молекул и т.д.), методы их очистки и выделения, а также роль индивидуальных белков в белков  в бохимических исследованиях.

       Доказано, что белки - обязательная составная  часть всех живых клеток, играют исключительно важную роль в живой  природе, являются главным, наиболее ценным и незаменимым компонентом питания. Это связанно с той огромной ролью, которую они играют в процессах  развития и жизни человека. Белки  являются основой структурных элементов  и тканей, поддерживают обмен веществ  и энергии, участвуют в процессах  роста и размножения, обеспечивают механизмы движений, развитие иммунных реакций, необходимы для функционирования всех органов и систем организма.

       «Жизнь - это форма существования белка» 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

       Список  использованных источников

       1. Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. - М.: Медицина, 1998. - 704 с.

       2. Филиппович Ю.Б. Основы биохимии. - М.: ИзD-во «Ангар», 1999. - 512 с.

       3. Жеребцов Н.А., Попова Т.Н., Артюхов  В.Г. Биохимия – Воронеж: Издательство ВГУ, 2002. - 696 с.

       4. Биохимия растительного сырья. /Под. ред. В.Г. Щербакова. - М.: Колос, 1999. - 376 с.

       5. Ленинджер А. Биохимия. - М.: Мир, 1999 Т 1-3.

       6. Основы биохимии / Под ред. А.А. Анисимова. - М.: Высшая школа, 1986. - 551 с.

       7. Кретович В.Л. Биохимия растений М.: Высш. школа, 1986, - 503 с.

       8. Химия и биохимия аминокислот  и полипептидов. Методические указания  для студентов технологических  специальностей по дисциплинам  «Органическая химия», «Биологческая химия» и «Химия природных волокнообразующих полимеров». МГУП, Могилев, 2003. - 43 с.